工程安全，水庫蓄水后，一旦失事將會造成不可估量的損失，為此要把這一問題放在首要位置加以考慮。除必須對采用的水文資料、地質(zhì)資料、水力計(jì)算、水工結(jié)構(gòu)分析等方面的可靠性進(jìn)行評價外，還要對某些自然因素、人為因素可能帶來的風(fēng)險作出估計(jì)。

泥沙問題，多泥沙河流上的水庫蓄水后，將引起水庫淤積和壩下游河道的沖刷，從而對航運(yùn)、 防洪、 供水等方面造成一些新問題。對此，要慎重對待，根據(jù)水庫運(yùn)用條件進(jìn)行沖淤分析計(jì)算。必要時要研究設(shè)置適當(dāng)?shù)呐派吃O(shè)施，并考慮對水庫運(yùn)行方式加以某些限制。

庫區(qū)淹沒，水庫淹沒處理是水庫工程建設(shè)的重要組成部分。編制工程規(guī)劃時，要根據(jù)水庫運(yùn)行方式，考慮淹沒對象的具體條件劃定淹沒范圍并擬定不同的處理標(biāo)準(zhǔn)，提出相應(yīng)的處理規(guī)劃。中國人多地少，許多水庫建設(shè)都將涉及大量移民安置問題。妥善安排移民生產(chǎn)生活，是處理規(guī)劃中的重要內(nèi)容（見水利工程淹沒處理）。生態(tài)環(huán)境，水庫建成后，對生態(tài)環(huán)境造成的影響，也常是衡量工程可行性的重要因素。通常需要考慮的，除上述因庫區(qū)移民、水庫泥沙帶來的問題外，通常還需考慮：水庫蓄水后對水溫、水質(zhì)、漁業(yè)生產(chǎn)條件、文化資源損失、庫區(qū)生物群體環(huán)境、疾病傳播與人群健康等方面的影響。所有這些都要作好預(yù)測并認(rèn)真加以分析。